Una de las principales vocaciones de ​IQS es fomentar y desarrollar la actividad investigadora de sus graduados. La realización de Tesis Doctorales es uno de los factores que ayuda a promover las actividades de I+D de los Grupos de Investigación de IQS

Los doctorados oficiales que se desarrollan en IQS son:

• Doctorado en Química e Ingeniería Química
• Doctorado en Bioingeniería
• Doctorado en Competitividad Empresarial y Territorial, Innovación y Sostenibilidad (programa conjunto con la Universidad de Deusto e ICADE de la Universidad Pontificia de Comillas)
• Los ámbitos de investigación son los propios de la actividad docente e investigadora de IQS y que, desde una amplia perspectiva, abarcan: química, ingeniería química, ingeniería industrial, biotecnología y bioingeniería, economía y empresa.

La beca de doctorado incluye la asignación de recursos económicos para los siguientes conceptos:

• La contratación laboral por parte de IQS del doctorando por un periodo máximo de tres años (cotizaciones sociales incluidas).
• La realización de cursos de doctorado en IQS o en alguna de sus Universidades asociadas.
• Los consumos de productos, materiales, equipos, servicios bibliográficos, etc. utilizados para la realización de los trabajos prácticos y experimentales.
• Una bolsa de viaje para presentar comunicaciones en congresos científicos internacionales y/o una estancia en reconocida universidad o centro de investigación extranjero.
• Las tasas oficiales de matrícula de doctorado en IQS.

Los ámbitos de investigación de IQS abarcan la química, ingeniería química, ingeniería industrial, biotecnología y bioingeniería, farmacia, economía, marketing y empresa.

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